Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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