Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR4P22455 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms