Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms