Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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