Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFTRP13569 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFTRP13569 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFTRP13569 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFTRP13569 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFTRP13569 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFTRP13569 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFTRP13569 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFTRP13569 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFTRP13569 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CFTRP13569 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CFTRP13569 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CFTRP13569 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFTRP13569 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFTRP13569 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFTRP13569 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFTRP13569 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CFTRP13569 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFTRP13569 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CFTRP13569 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFTRP13569 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFTRP13569 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CFTRP13569 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms