Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB1P08034 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB1P08034 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms