Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEBLO76041 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEBLO76041 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NEBLO76041 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms