Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLDN11O75508 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLDN11O75508 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLDN11O75508 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLDN11O75508 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLDN11O75508 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLDN11O75508 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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CLDN11O75508 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CLDN11O75508 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLDN11O75508 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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