Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP8B1O43520 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP8B1O43520 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms