Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM6BO15054 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM6BO15054 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms