Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms