Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms