Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms