Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms