Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E9PBE3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
E9PBE3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms