Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VGLL3A8MV65 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VGLL3A8MV65 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms