Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID3CA6NKF2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms