Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms