Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms