Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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