Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms