Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
HECTD4Q9Y4D8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms