Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SH3BP1Q9Y3L3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SH3BP1Q9Y3L3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SH3BP1Q9Y3L3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SH3BP1Q9Y3L3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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