Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZDHHC9Q9Y397 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZDHHC9Q9Y397 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms