Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms