Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms