Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SH3BP4Q9P0V3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SH3BP4Q9P0V3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SH3BP4Q9P0V3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SH3BP4Q9P0V3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SH3BP4Q9P0V3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SH3BP4Q9P0V3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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