Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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