Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms