Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ABCC13Q9NSE7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms