Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SEMA4BQ9NPR2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms