Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PNPLA8Q9NP80 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms