Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GOPCQ9HD26 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GOPCQ9HD26 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms