Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHOJQ9H4E5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms