Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHACTR1Q9C0D0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms