Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AMBRA1Q9C0C7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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