Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRP1Q9C000 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP1Q9C000 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms