Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
KRTAP4-3Q9BYR4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms