Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms