Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB11FIP5Q9BXF6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms