Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BRIP1Q9BX63 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms