Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PITX2Q99697 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms