Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SORT1Q99523 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SORT1Q99523 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms