Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NOTCH4Q99466 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NOTCH4Q99466 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NOTCH4Q99466 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NOTCH4Q99466 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NOTCH4Q99466 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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