Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC7Q96M83 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms