Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PRRC1Q96M27 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms