Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
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