Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC11Q96DB2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms