Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NMD3Q96D46 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NMD3Q96D46 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms