Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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RABGGTAQ92696 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RABGGTAQ92696 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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